| Ident. | Authors (with country if any) | Title |
|---|
| 000051 (2020) |
Paul Daly [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Vasanth R. Singan [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] | Mixtures of aromatic compounds induce ligninolytic gene expression in the wood-rotting fungus Dichomitus squalens. |
| 000163 (2020) |
Shingo Miyauchi [France] ; Hayat Hage [France] ; Elodie Drula [France] ; Laurence Lesage-Meessen [France] ; Jean-Guy Berrin [France] ; David Navarro [France] ; Anne Favel [France] ; Delphine Chaduli [France] ; Sacha Grisel [France] ; Mireille Haon [France] ; François Piumi [France] ; Anthony Levasseur ; Anne Lomascolo [France] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Kurt M. Labutti [États-Unis] ; Didier Chevret [France] ; Chris Daum [États-Unis] ; Jérôme Mariette [France] ; Christophe Klopp [France] ; Daniel Cullen [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] ; Allen C. Gathman [États-Unis] ; Matthieu Hainaut [France] ; Bernard Henrissat [France] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Ursula Kües [Allemagne] ; Walt Lilly [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Angel T. Martinez [Espagne] ; Mélanie Morel-Rouhier [France] ; Emmanuelle Morin [France] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Arthur F J. Ram [Pays-Bas] ; Han A B. Wösten [Pays-Bas] ; Francisco J. Ruiz-Due As [Espagne] ; Robert Riley [États-Unis] ; Eric Record [France] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Marie-Noëlle Rosso [France] | Conserved white-rot enzymatic mechanism for wood decay in the Basidiomycota genus Pycnoporus. |
| 000264 (2019) |
Paul Daly [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Marcos Di Falco [Canada] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Adrian Tsang [Canada] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] | Glucose-Mediated Repression of Plant Biomass Utilization in the White-Rot Fungus Dichomitus squalens. |
| 000295 (2019) |
Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Paul Daly [Pays-Bas] ; Bill Andreopoulos [États-Unis] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Chris Daum [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Finlande, Pays-Bas] | Draft Genome Sequences of Three Monokaryotic Isolates of the White-Rot Basidiomycete Fungus Dichomitus squalens. |
| 000358 (2018) |
Mila Marinovi [Finlande] ; Maria Victoria Aguilar-Pontes [Pays-Bas] ; Miaomiao Zhou [Pays-Bas] ; Otto Miettinen [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Kristiina Hildén [Finlande] | Temporal transcriptome analysis of the white-rot fungus Obba rivulosa shows expression of a constitutive set of plant cell wall degradation targeted genes during growth on solid spruce wood. |
| 000372 (2018) |
Mila Marinovi [Finlande] ; Paula Nousiainen [Finlande] ; Adiphol Dilokpimol [Pays-Bas] ; Jussi Kontro [Finlande] ; Robin Moore [Finlande] ; Jussi Sipil [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Finlande, Pays-Bas] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Kristiina Hildén [Finlande] | Selective Cleavage of Lignin β-O-4 Aryl Ether Bond by β-Etherase of the White-Rot Fungus Dichomitus squalens. |
| 000412 (2018) |
Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Tedros Yonatan Issak [Pays-Bas] ; Paul Daly [Pays-Bas] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] | Induction of Genes Encoding Plant Cell Wall-Degrading Carbohydrate-Active Enzymes by Lignocellulose-Derived Monosaccharides and Cellobiose in the White-Rot Fungus Dichomitus squalens. |
| 000448 (2018) |
Miia R. M Kel [Finlande] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Zoraide Granchi [Pays-Bas] ; Thomas Chin-A-Woeng [Pays-Bas] ; Rosa Hegi [Pays-Bas] ; Sake I. Van Pelt [Pays-Bas] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Matthieu Hainaut [France] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] | Draft Genome Sequence of the Basidiomycete White-Rot Fungus Phlebia centrifuga. |
| 000451 (2018) |
Paul Daly [Pays-Bas] ; Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Christopher S. Lancefield [Pays-Bas] ; Samuel O. Purvine [États-Unis] ; Young-Mo Kim [États-Unis] ; Erika M. Zink [États-Unis] ; Alice Dohnalkova [États-Unis] ; Vasanth R. Singan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; David Dilworth [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Errol Robinson [États-Unis] ; Galya Orr [États-Unis] ; Scott E. Baker [États-Unis] ; Pieter C A. Bruijnincx [Pays-Bas] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] | Dichomitus squalens partially tailors its molecular responses to the composition of solid wood. |
| 000504 (2017) |
Johanna Rytioja [Finlande] ; Kristiina Hildén [Finlande] ; Marcos Di Falco [Finlande] ; Miaomiao Zhou [Pays-Bas] ; Maria Victoria Aguilar-Pontes [Pays-Bas] ; Outi-Maaria Sietiö [Finlande] ; Adrian Tsang [Canada] ; Ronald P. De Vries [Finlande, Pays-Bas] ; Miia R. M Kel [Finlande] | The molecular response of the white-rot fungus Dichomitus squalens to wood and non-woody biomass as examined by transcriptome and exoproteome analyses. |
| 000560 (2017) |
Zoraide Granchi [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Thomas Chi-A-Woeng [Pays-Bas] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] ; Kristiina Hildén [Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] | Genome Sequence of the Basidiomycete White-Rot Fungus Trametes pubescens FBCC735. |
| 000561 (2017) |
Paul Daly [Pays-Bas] ; Gillian G. Slaghek [Pays-Bas] ; Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Ad Wiebenga [Pays-Bas] ; Kristiina S. Hilden [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] | Genetic transformation of the white-rot fungus Dichomitus squalens using a new commercial protoplasting cocktail. |
| 000566 (2017) |
Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Bart Theelen [Pays-Bas] ; Serena Manserra [Pays-Bas] ; Tedros Yonatan Issak [Pays-Bas] ; Johanna Rytioja [Finlande] ; Miia R. M Kel [Pays-Bas, Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] | Functional diversity in Dichomitus squalens monokaryons. |
| 000725 (2016) |
Otto Miettinen [Finlande] ; Robert Riley [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Dan Cullen [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Finlande] ; Matthieu Hainaut [France] ; Annele Hatakka [Finlande] ; Bernard Henrissat [Arabie saoudite] ; Kristiina Hildén [Finlande] ; Rita Kuo [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Laura Sandor [États-Unis] ; Joseph W. Spatafora [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; David S. Hibbett [États-Unis] | Draft Genome Sequence of the White-Rot Fungus Obba rivulosa 3A-2. |
| 000896 (2015) |
Miia R. M Kel [Finlande] ; Mila Marinovi [Finlande] ; Paula Nousiainen [Finlande] ; April J M. Liwanag [Pays-Bas] ; Isabelle Benoit [Pays-Bas] ; Jussi Sipil [Finlande] ; Annele Hatakka [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] | Aromatic metabolism of filamentous fungi in relation to the presence of aromatic compounds in plant biomass. |
| 000934 (2014) |
Anthony Levasseur [France] ; Anne Lomascolo ; Olivier Chabrol ; Francisco J. Ruiz-Due As ; Eva Boukhris-Uzan ; François Piumi ; Ursula Kües ; Arthur F J. Ram ; Claude Murat ; Mireille Haon ; Isabelle Benoit ; Yonathan Arfi ; Didier Chevret ; Elodie Drula ; Min Jin Kwon ; Philippe Gouret ; Laurence Lesage-Meessen ; Vincent Lombard ; Jérôme Mariette ; Céline Noirot ; Joohae Park ; Aleksandrina Patyshakuliyeva ; Jean Claude Sigoillot ; Ad Wiebenga ; Han A B. Wösten ; Francis Martin ; Pedro M. Coutinho ; Ronald P. De Vries ; Angel T. Martínez ; Christophe Klopp ; Pierre Pontarotti ; Bernard Henrissat ; Eric Record | The genome of the white-rot fungus Pycnoporus cinnabarinus: a basidiomycete model with a versatile arsenal for lignocellulosic biomass breakdown. |
| 000960 (2014) |
Miia R. M Kel [Finlande] ; Outi-Maaria Sietiö [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas] ; Sari Timonen [Finlande] ; Kristiina Hildén [Finlande] | Oxalate-metabolising genes of the white-rot fungus Dichomitus squalens are differentially induced on wood and at high proton concentration. |
| 000D18 (2012) |
Dimitrios Floudas [États-Unis] ; Manfred Binder ; Robert Riley ; Kerrie Barry ; Robert A. Blanchette ; Bernard Henrissat ; Angel T. Martínez ; Robert Otillar ; Joseph W. Spatafora ; Jagjit S. Yadav ; Andrea Aerts ; Isabelle Benoit ; Alex Boyd ; Alexis Carlson ; Alex Copeland ; Pedro M. Coutinho ; Ronald P. De Vries ; Patricia Ferreira ; Keisha Findley ; Brian Foster ; Jill Gaskell ; Dylan Glotzer ; Paweł G Recki ; Joseph Heitman ; Cedar Hesse ; Chiaki Hori ; Kiyohiko Igarashi ; Joel A. Jurgens ; Nathan Kallen ; Phil Kersten ; Annegret Kohler ; Ursula Kües ; T K Arun Kumar ; Alan Kuo ; Kurt Labutti ; Luis F. Larrondo ; Erika Lindquist ; Albee Ling ; Vincent Lombard ; Susan Lucas ; Taina Lundell ; Rachael Martin ; David J. Mclaughlin ; Ingo Morgenstern ; Emanuelle Morin ; Claude Murat ; Laszlo G. Nagy ; Matt Nolan ; Robin A. Ohm ; Aleksandrina Patyshakuliyeva ; Antonis Rokas ; Francisco J. Ruiz-Due As ; Grzegorz Sabat ; Asaf Salamov ; Masahiro Samejima ; Jeremy Schmutz ; Jason C. Slot ; Franz St John ; Jan Stenlid ; Hui Sun ; Sheng Sun ; Khajamohiddin Syed ; Adrian Tsang ; Ad Wiebenga ; Darcy Young ; Antonio Pisabarro ; Daniel C. Eastwood ; Francis Martin ; Dan Cullen ; Igor V. Grigoriev ; David S. Hibbett | The Paleozoic origin of enzymatic lignin decomposition reconstructed from 31 fungal genomes. |
| 000E49 (2012) |
Hitoshi Suzuki [Canada] ; Jacqueline Macdonald ; Khajamohiddin Syed ; Asaf Salamov ; Chiaki Hori ; Andrea Aerts ; Bernard Henrissat ; Ad Wiebenga ; Patricia A. Vankuyk ; Kerrie Barry ; Erika Lindquist ; Kurt Labutti ; Alla Lapidus ; Susan Lucas ; Pedro Coutinho ; Yunchen Gong ; Masahiro Samejima ; Radhakrishnan Mahadevan ; Mamdouh Abou-Zaid ; Ronald P. De Vries ; Kiyohiko Igarashi ; Jagjit S. Yadav ; Igor V. Grigoriev ; Emma R. Master | Comparative genomics of the white-rot fungi, Phanerochaete carnosa and P. chrysosporium, to elucidate the genetic basis of the distinct wood types they colonize. |
| 000E50 (2012) |
Elena Fernandez-Fueyo [Espagne] ; Francisco J. Ruiz-Due As ; Patricia Ferreira ; Dimitrios Floudas ; David S. Hibbett ; Paulo Canessa ; Luis F. Larrondo ; Tim Y. James ; Daniela Seelenfreund ; Sergio Lobos ; Rubén Polanco ; Mario Tello ; Yoichi Honda ; Takahito Watanabe ; Takashi Watanabe ; Jae San Ryu ; Ryu Jae San ; Christian P. Kubicek ; Monika Schmoll ; Jill Gaskell ; Kenneth E. Hammel ; Franz J. St John ; Amber Vanden Wymelenberg ; Grzegorz Sabat ; Sandra Splinter Bondurant ; Khajamohiddin Syed ; Jagjit S. Yadav ; Harshavardhan Doddapaneni ; Venkataramanan Subramanian ; José L. Lavín ; José A. Oguiza ; Gumer Perez ; Antonio G. Pisabarro ; Lucia Ramirez ; Francisco Santoyo ; Emma Master ; Pedro M. Coutinho ; Bernard Henrissat ; Vincent Lombard ; Jon Karl Magnuson ; Ursula Kües ; Chiaki Hori ; Kiyohiko Igarashi ; Masahiro Samejima ; Benjamin W. Held ; Kerrie W. Barry ; Kurt M. Labutti ; Alla Lapidus ; Erika A. Lindquist ; Susan M. Lucas ; Robert Riley ; Asaf A. Salamov ; Dirk Hoffmeister ; Daniel Schwenk ; Yitzhak Hadar ; Oded Yarden ; Ronald P. De Vries ; Ad Wiebenga ; Jan Stenlid ; Daniel Eastwood ; Igor V. Grigoriev ; Randy M. Berka ; Robert A. Blanchette ; Phil Kersten ; Angel T. Martinez ; Rafael Vicuna ; Dan Cullen | Comparative genomics of Ceriporiopsis subvermispora and Phanerochaete chrysosporium provide insight into selective ligninolysis. |
| 000F01 (2011) |
Daniel C. Eastwood [Royaume-Uni] ; Dimitrios Floudas ; Manfred Binder ; Andrzej Majcherczyk ; Patrick Schneider ; Andrea Aerts ; Fred O. Asiegbu ; Scott E. Baker ; Kerrie Barry ; Mika Bendiksby ; Melanie Blumentritt ; Pedro M. Coutinho ; Dan Cullen ; Ronald P. De Vries ; Allen Gathman ; Barry Goodell ; Bernard Henrissat ; Katarina Ihrmark ; H Vard Kauserud ; Annegret Kohler ; Kurt Labutti ; Alla Lapidus ; José L. Lavin ; Yong-Hwan Lee ; Erika Lindquist ; Walt Lilly ; Susan Lucas ; Emmanuelle Morin ; Claude Murat ; José A. Oguiza ; Jongsun Park ; Antonio G. Pisabarro ; Robert Riley ; Anna Rosling ; Asaf Salamov ; Olaf Schmidt ; Jeremy Schmutz ; Inger Skrede ; Jan Stenlid ; Ad Wiebenga ; Xinfeng Xie ; Ursula Kües ; David S. Hibbett ; Dirk Hoffmeister ; Nils Högberg ; Francis Martin ; Igor V. Grigoriev ; Sarah C. Watkinson | The plant cell wall-decomposing machinery underlies the functional diversity of forest fungi. |
