| Ident. | Authors (with country if any) | Title |
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| 000077 (2020) |
Abbot O. Oghenekaro [Nigeria, Finlande, Canada] ; Andriy Kovalchuk [Finlande] ; Tommaso Raffaello [Finlande] ; Susana Camarero [Espagne] ; Markus Gressler [Allemagne] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Juna Lee [États-Unis] ; Mengxia Liu [Finlande] ; Angel T. Martínez [Espagne] ; Otto Miettinen [Finlande] ; Sirma Mihaltcheva [États-Unis] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Fei Ren [Finlande, République populaire de Chine] ; Robert Riley [États-Unis] ; Francisco Javier Ruiz-Due As [Espagne] ; Ana Serrano [Espagne] ; Michael R. Thon [Espagne] ; Zilan Wen [Finlande] ; Zhen Zeng [Finlande] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Francis Martin [France] ; Fred O. Asiegbu [Finlande] | Genome sequencing of Rigidoporus microporus provides insights on genes important for wood decay, latex tolerance and interspecific fungal interactions. |
| 000163 (2020) |
Shingo Miyauchi [France] ; Hayat Hage [France] ; Elodie Drula [France] ; Laurence Lesage-Meessen [France] ; Jean-Guy Berrin [France] ; David Navarro [France] ; Anne Favel [France] ; Delphine Chaduli [France] ; Sacha Grisel [France] ; Mireille Haon [France] ; François Piumi [France] ; Anthony Levasseur ; Anne Lomascolo [France] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Kurt M. Labutti [États-Unis] ; Didier Chevret [France] ; Chris Daum [États-Unis] ; Jérôme Mariette [France] ; Christophe Klopp [France] ; Daniel Cullen [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] ; Allen C. Gathman [États-Unis] ; Matthieu Hainaut [France] ; Bernard Henrissat [France] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Ursula Kües [Allemagne] ; Walt Lilly [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Angel T. Martinez [Espagne] ; Mélanie Morel-Rouhier [France] ; Emmanuelle Morin [France] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Arthur F J. Ram [Pays-Bas] ; Han A B. Wösten [Pays-Bas] ; Francisco J. Ruiz-Due As [Espagne] ; Robert Riley [États-Unis] ; Eric Record [France] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Marie-Noëlle Rosso [France] | Conserved white-rot enzymatic mechanism for wood decay in the Basidiomycota genus Pycnoporus. |
| 000295 (2019) |
Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Paul Daly [Pays-Bas] ; Bill Andreopoulos [États-Unis] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Chris Daum [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Finlande, Pays-Bas] | Draft Genome Sequences of Three Monokaryotic Isolates of the White-Rot Basidiomycete Fungus Dichomitus squalens. |
| 000305 (2019) |
Hongjae Park [Corée du Sud] ; Byoungnam Min [États-Unis] ; Yeongseon Jang [Corée du Sud] ; Jungyeon Kim [Corée du Sud] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Aditi Sharma [États-Unis] ; Bill Andreopoulos [États-Unis] ; Jenifer Johnson [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Joseph W. Spatafora [États-Unis] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Kyoung Heon Kim [Corée du Sud] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Jae-Jin Kim [Corée du Sud] ; In-Geol Choi [Corée du Sud] | Comprehensive genomic and transcriptomic analysis of polycyclic aromatic hydrocarbon degradation by a mycoremediation fungus, Dentipellis sp. KUC8613. |
| 000308 (2019) |
Éva Almási [Hongrie] ; Neha Sahu [Hongrie] ; Krisztina Krizsán [Hongrie] ; Balázs Bálint [Hongrie] ; Gábor M. Kovács [Hongrie] ; Brigitta Kiss [Hongrie] ; Judit Cseklye [Hongrie] ; Elodie Drula [France] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; István Nagy [Hongrie] ; Mansi Chovatia [États-Unis] ; Catherine Adam [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Lászl G. Nagy [Hongrie] | Comparative genomics reveals unique wood-decay strategies and fruiting body development in the Schizophyllaceae. |
| 000410 (2018) |
Shingo Miyauchi [France] ; Anaïs Rancon [France] ; Elodie Drula [France] ; Hayat Hage [France] ; Delphine Chaduli [France] ; Anne Favel [France] ; Sacha Grisel [France] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Isabelle Herpoël-Gimbert [France] ; Francisco J. Ruiz-Due As [Espagne] ; Didier Chevret [France] ; Matthieu Hainaut [France] ; Junyan Lin [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Laurence Lesage-Meessen [France] ; David Navarro [France] ; Robert Riley [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Simeng Zhou [France] ; Sana Raouche [France] ; Marie-Noëlle Rosso [France] | Integrative visual omics of the white-rot fungus Polyporus brumalis exposes the biotechnological potential of its oxidative enzymes for delignifying raw plant biomass. |
| 000421 (2018) |
Baojun Wu [États-Unis] ; Zhangyi Xu [République populaire de Chine] ; Alicia Knudson [États-Unis] ; Alexis Carlson [États-Unis] ; Naiyao Chen [République populaire de Chine] ; Sam Kovaka [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Christa Pennachio [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Wendy Schakwitz [États-Unis] ; Kiwamu Umezawa [États-Unis, Japon] ; Robin A. Ohm [Pays-Bas] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Lászl G. Nagy [Hongrie] ; John Gibbons [États-Unis] ; David Hibbett [États-Unis] | Genomics and Development of Lentinus tigrinus: A White-Rot Wood-Decaying Mushroom with Dimorphic Fruiting Bodies. |
| 000448 (2018) |
Miia R. M Kel [Finlande] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Zoraide Granchi [Pays-Bas] ; Thomas Chin-A-Woeng [Pays-Bas] ; Rosa Hegi [Pays-Bas] ; Sake I. Van Pelt [Pays-Bas] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Matthieu Hainaut [France] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] | Draft Genome Sequence of the Basidiomycete White-Rot Fungus Phlebia centrifuga. |
| 000562 (2017) |
Lászl G. Nagy [Hongrie] ; Robert Riley [États-Unis] ; Philip J. Bergmann [États-Unis] ; Krisztina Krizsán [Hongrie] ; Francis M. Martin [France] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Dan Cullen [États-Unis] ; David S. Hibbett [États-Unis] | Genetic Bases of Fungal White Rot Wood Decay Predicted by Phylogenomic Analysis of Correlated Gene-Phenotype Evolution. |
| 000725 (2016) |
Otto Miettinen [Finlande] ; Robert Riley [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Dan Cullen [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Finlande] ; Matthieu Hainaut [France] ; Annele Hatakka [Finlande] ; Bernard Henrissat [Arabie saoudite] ; Kristiina Hildén [Finlande] ; Rita Kuo [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Laura Sandor [États-Unis] ; Joseph W. Spatafora [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; David S. Hibbett [États-Unis] | Draft Genome Sequence of the White-Rot Fungus Obba rivulosa 3A-2. |
| 000745 (2016) |
Lászl G. Nagy [Hongrie] ; Robert Riley [États-Unis] ; Andrew Tritt [États-Unis] ; Catherine Adam [États-Unis] ; Chris Daum [États-Unis] ; Dimitrios Floudas [Suède] ; Hui Sun [États-Unis] ; Jagjit S. Yadav ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Karl-Henrik Larsson [Norvège] ; Kenji Matsuura [Japon] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Rita Kuo [États-Unis] ; Robin A. Ohm [Pays-Bas] ; Sukanta S. Bhattacharya ; Takashi Shirouzu [Japon] ; Yuko Yoshinaga [États-Unis] ; Francis M. Martin [France] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; David S. Hibbett [Hongrie] | Comparative Genomics of Early-Diverging Mushroom-Forming Fungi Provides Insights into the Origins of Lignocellulose Decay Capabilities. |
| 000837 (2015) |
Byoungnam Min [Corée du Sud] ; Hongjae Park [Corée du Sud] ; Yeongseon Jang [Corée du Sud] ; Jae-Jin Kim [Corée du Sud] ; Kyoung Heon Kim [Corée du Sud] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Joseph W. Spatafora [États-Unis] ; In-Geol Choi [Corée du Sud] | Genome sequence of a white rot fungus Schizopora paradoxa KUC8140 for wood decay and mycoremediation. |
| 000856 (2015) |
Dimitrios Floudas [Suède] ; Benjamin W. Held [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Laszlo G. Nagy [Hongrie] ; Gage Koehler [États-Unis] ; Anthony S. Ransdell [États-Unis] ; Hina Younus [États-Unis] ; Julianna Chow [États-Unis] ; Jennifer Chiniquy [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Andrew Tritt [États-Unis] ; Hui Sun [États-Unis] ; Sajeet Haridas [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Robin A. Ohm [Pays-Bas] ; Ursula Kües [Allemagne] ; Robert A. Blanchette [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Robert E. Minto [États-Unis] ; David S. Hibbett [États-Unis] | Evolution of novel wood decay mechanisms in Agaricales revealed by the genome sequences of Fistulina hepatica and Cylindrobasidium torrendii. |
| 000862 (2015) |
Marie Couturier [France] ; David Navarro [France] ; Didier Chevret [France] ; Bernard Henrissat [France] ; François Piumi [France] ; Francisco J. Ruiz-Due As [Espagne] ; Angel T. Martinez [Espagne] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Jean-Guy Berrin [France] ; Emma R. Master [Canada] ; Marie-Noëlle Rosso [France] | Enhanced degradation of softwood versus hardwood by the white-rot fungus Pycnoporus coccineus. |
| 000990 (2014) |
Robin A. Ohm [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Asaf Salamov [États-Unis] ; Byoungnam Min [Corée du Sud] ; In-Geol Choi [Corée du Sud] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] | Genomics of wood-degrading fungi. |
| 000A69 (2014) |
Robert Riley [États-Unis] ; Asaf A. Salamov [États-Unis] ; Daren W. Brown [États-Unis] ; Laszlo G. Nagy [États-Unis] ; Dimitrios Floudas [États-Unis] ; Benjamin W. Held [États-Unis] ; Anthony Levasseur [France] ; Vincent Lombard [France] ; Emmanuelle Morin [France] ; Robert Otillar [États-Unis] ; Erika A. Lindquist [États-Unis] ; Hui Sun [États-Unis] ; Kurt M. Labutti [États-Unis] ; Jeremy Schmutz [États-Unis] ; Dina Jabbour [États-Unis] ; Hong Luo [États-Unis] ; Scott E. Baker [États-Unis] ; Antonio G. Pisabarro ; Jonathan D. Walton [États-Unis] ; Robert A. Blanchette [États-Unis] ; Bernard Henrissat [France] ; Francis Martin [France] ; Dan Cullen [États-Unis] ; David S. Hibbett [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] | Extensive sampling of basidiomycete genomes demonstrates inadequacy of the white-rot/brown-rot paradigm for wood decay fungi. |
| 000B17 (2014) |
Chiaki Hori [Japon] ; Takuya Ishida [Japon] ; Kiyohiko Igarashi [Japon] ; Masahiro Samejima [Japon] ; Hitoshi Suzuki [Canada] ; Emma Master [Canada] ; Patricia Ferreira [Espagne] ; Francisco J. Ruiz-Due As [Espagne] ; Benjamin Held [États-Unis] ; Paulo Canessa [Chili] ; Luis F. Larrondo [Chili] ; Monika Schmoll [Autriche] ; Irina S. Druzhinina [Autriche] ; Christian P. Kubicek [Autriche] ; Jill A. Gaskell [États-Unis] ; Phil Kersten [États-Unis] ; Franz St John [États-Unis] ; Jeremy Glasner [États-Unis] ; Grzegorz Sabat [États-Unis] ; Sandra Splinter Bondurant [États-Unis] ; Khajamohiddin Syed [États-Unis] ; Jagjit Yadav [États-Unis] ; Anthony C. Mgbeahuruike [Finlande] ; Andriy Kovalchuk [Finlande] ; Fred O. Asiegbu [Finlande] ; Gerald Lackner [Allemagne] ; Dirk Hoffmeister [Allemagne] ; Jorge Rencoret [Espagne] ; Ana Gutiérrez [Espagne] ; Hui Sun [États-Unis] ; Erika Lindquist [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Bernard Henrissat [France] ; Ursula Kües [Allemagne] ; Randy M. Berka [États-Unis] ; Angel T. Martínez [Espagne] ; Sarah F. Covert [États-Unis] ; Robert A. Blanchette [États-Unis] ; Daniel Cullen [États-Unis] | Analysis of the Phlebiopsis gigantea genome, transcriptome and secretome provides insight into its pioneer colonization strategies of wood. |
| 000B27 (2013) |
Khajamohiddin Syed [États-Unis] ; David R. Nelson ; Robert Riley ; Jagjit S. Yadav | Genomewide annotation and comparative genomics of cytochrome P450 monooxygenases (P450s) in the polypore species Bjerkandera adusta, Ganoderma sp. and Phlebia brevispora. |
| 000D18 (2012) |
Dimitrios Floudas [États-Unis] ; Manfred Binder ; Robert Riley ; Kerrie Barry ; Robert A. Blanchette ; Bernard Henrissat ; Angel T. Martínez ; Robert Otillar ; Joseph W. Spatafora ; Jagjit S. Yadav ; Andrea Aerts ; Isabelle Benoit ; Alex Boyd ; Alexis Carlson ; Alex Copeland ; Pedro M. Coutinho ; Ronald P. De Vries ; Patricia Ferreira ; Keisha Findley ; Brian Foster ; Jill Gaskell ; Dylan Glotzer ; Paweł G Recki ; Joseph Heitman ; Cedar Hesse ; Chiaki Hori ; Kiyohiko Igarashi ; Joel A. Jurgens ; Nathan Kallen ; Phil Kersten ; Annegret Kohler ; Ursula Kües ; T K Arun Kumar ; Alan Kuo ; Kurt Labutti ; Luis F. Larrondo ; Erika Lindquist ; Albee Ling ; Vincent Lombard ; Susan Lucas ; Taina Lundell ; Rachael Martin ; David J. Mclaughlin ; Ingo Morgenstern ; Emanuelle Morin ; Claude Murat ; Laszlo G. Nagy ; Matt Nolan ; Robin A. Ohm ; Aleksandrina Patyshakuliyeva ; Antonis Rokas ; Francisco J. Ruiz-Due As ; Grzegorz Sabat ; Asaf Salamov ; Masahiro Samejima ; Jeremy Schmutz ; Jason C. Slot ; Franz St John ; Jan Stenlid ; Hui Sun ; Sheng Sun ; Khajamohiddin Syed ; Adrian Tsang ; Ad Wiebenga ; Darcy Young ; Antonio Pisabarro ; Daniel C. Eastwood ; Francis Martin ; Dan Cullen ; Igor V. Grigoriev ; David S. Hibbett | The Paleozoic origin of enzymatic lignin decomposition reconstructed from 31 fungal genomes. |
| 000E50 (2012) |
Elena Fernandez-Fueyo [Espagne] ; Francisco J. Ruiz-Due As ; Patricia Ferreira ; Dimitrios Floudas ; David S. Hibbett ; Paulo Canessa ; Luis F. Larrondo ; Tim Y. James ; Daniela Seelenfreund ; Sergio Lobos ; Rubén Polanco ; Mario Tello ; Yoichi Honda ; Takahito Watanabe ; Takashi Watanabe ; Jae San Ryu ; Ryu Jae San ; Christian P. Kubicek ; Monika Schmoll ; Jill Gaskell ; Kenneth E. Hammel ; Franz J. St John ; Amber Vanden Wymelenberg ; Grzegorz Sabat ; Sandra Splinter Bondurant ; Khajamohiddin Syed ; Jagjit S. Yadav ; Harshavardhan Doddapaneni ; Venkataramanan Subramanian ; José L. Lavín ; José A. Oguiza ; Gumer Perez ; Antonio G. Pisabarro ; Lucia Ramirez ; Francisco Santoyo ; Emma Master ; Pedro M. Coutinho ; Bernard Henrissat ; Vincent Lombard ; Jon Karl Magnuson ; Ursula Kües ; Chiaki Hori ; Kiyohiko Igarashi ; Masahiro Samejima ; Benjamin W. Held ; Kerrie W. Barry ; Kurt M. Labutti ; Alla Lapidus ; Erika A. Lindquist ; Susan M. Lucas ; Robert Riley ; Asaf A. Salamov ; Dirk Hoffmeister ; Daniel Schwenk ; Yitzhak Hadar ; Oded Yarden ; Ronald P. De Vries ; Ad Wiebenga ; Jan Stenlid ; Daniel Eastwood ; Igor V. Grigoriev ; Randy M. Berka ; Robert A. Blanchette ; Phil Kersten ; Angel T. Martinez ; Rafael Vicuna ; Dan Cullen | Comparative genomics of Ceriporiopsis subvermispora and Phanerochaete chrysosporium provide insight into selective ligninolysis. |
| 000F01 (2011) |
Daniel C. Eastwood [Royaume-Uni] ; Dimitrios Floudas ; Manfred Binder ; Andrzej Majcherczyk ; Patrick Schneider ; Andrea Aerts ; Fred O. Asiegbu ; Scott E. Baker ; Kerrie Barry ; Mika Bendiksby ; Melanie Blumentritt ; Pedro M. Coutinho ; Dan Cullen ; Ronald P. De Vries ; Allen Gathman ; Barry Goodell ; Bernard Henrissat ; Katarina Ihrmark ; H Vard Kauserud ; Annegret Kohler ; Kurt Labutti ; Alla Lapidus ; José L. Lavin ; Yong-Hwan Lee ; Erika Lindquist ; Walt Lilly ; Susan Lucas ; Emmanuelle Morin ; Claude Murat ; José A. Oguiza ; Jongsun Park ; Antonio G. Pisabarro ; Robert Riley ; Anna Rosling ; Asaf Salamov ; Olaf Schmidt ; Jeremy Schmutz ; Inger Skrede ; Jan Stenlid ; Ad Wiebenga ; Xinfeng Xie ; Ursula Kües ; David S. Hibbett ; Dirk Hoffmeister ; Nils Högberg ; Francis Martin ; Igor V. Grigoriev ; Sarah C. Watkinson | The plant cell wall-decomposing machinery underlies the functional diversity of forest fungi. |
