Ident. | Authors (with country if any) | Title |
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000051 (2020) |
Paul Daly [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Vasanth R. Singan [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] | Mixtures of aromatic compounds induce ligninolytic gene expression in the wood-rotting fungus Dichomitus squalens. |
000077 (2020) |
Abbot O. Oghenekaro [Nigeria, Finlande, Canada] ; Andriy Kovalchuk [Finlande] ; Tommaso Raffaello [Finlande] ; Susana Camarero [Espagne] ; Markus Gressler [Allemagne] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Juna Lee [États-Unis] ; Mengxia Liu [Finlande] ; Angel T. Martínez [Espagne] ; Otto Miettinen [Finlande] ; Sirma Mihaltcheva [États-Unis] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Fei Ren [Finlande, République populaire de Chine] ; Robert Riley [États-Unis] ; Francisco Javier Ruiz-Due As [Espagne] ; Ana Serrano [Espagne] ; Michael R. Thon [Espagne] ; Zilan Wen [Finlande] ; Zhen Zeng [Finlande] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Francis Martin [France] ; Fred O. Asiegbu [Finlande] | Genome sequencing of Rigidoporus microporus provides insights on genes important for wood decay, latex tolerance and interspecific fungal interactions. |
000163 (2020) |
Shingo Miyauchi [France] ; Hayat Hage [France] ; Elodie Drula [France] ; Laurence Lesage-Meessen [France] ; Jean-Guy Berrin [France] ; David Navarro [France] ; Anne Favel [France] ; Delphine Chaduli [France] ; Sacha Grisel [France] ; Mireille Haon [France] ; François Piumi [France] ; Anthony Levasseur ; Anne Lomascolo [France] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Kurt M. Labutti [États-Unis] ; Didier Chevret [France] ; Chris Daum [États-Unis] ; Jérôme Mariette [France] ; Christophe Klopp [France] ; Daniel Cullen [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] ; Allen C. Gathman [États-Unis] ; Matthieu Hainaut [France] ; Bernard Henrissat [France] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Ursula Kües [Allemagne] ; Walt Lilly [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Angel T. Martinez [Espagne] ; Mélanie Morel-Rouhier [France] ; Emmanuelle Morin [France] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Arthur F J. Ram [Pays-Bas] ; Han A B. Wösten [Pays-Bas] ; Francisco J. Ruiz-Due As [Espagne] ; Robert Riley [États-Unis] ; Eric Record [France] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Marie-Noëlle Rosso [France] | Conserved white-rot enzymatic mechanism for wood decay in the Basidiomycota genus Pycnoporus. |
000203 (2019) |
Joanna E. Kowalczyk [Finlande] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Megan Pawlowski [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Vasanth Singan [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] | The White-Rot Basidiomycete Dichomitus squalens Shows Highly Specific Transcriptional Response to Lignocellulose-Related Aromatic Compounds. |
000264 (2019) |
Paul Daly [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Marcos Di Falco [Canada] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Adrian Tsang [Canada] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] | Glucose-Mediated Repression of Plant Biomass Utilization in the White-Rot Fungus Dichomitus squalens. |
000295 (2019) |
Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Paul Daly [Pays-Bas] ; Bill Andreopoulos [États-Unis] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Chris Daum [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Finlande, Pays-Bas] | Draft Genome Sequences of Three Monokaryotic Isolates of the White-Rot Basidiomycete Fungus Dichomitus squalens. |
000305 (2019) |
Hongjae Park [Corée du Sud] ; Byoungnam Min [États-Unis] ; Yeongseon Jang [Corée du Sud] ; Jungyeon Kim [Corée du Sud] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Aditi Sharma [États-Unis] ; Bill Andreopoulos [États-Unis] ; Jenifer Johnson [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Joseph W. Spatafora [États-Unis] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Kyoung Heon Kim [Corée du Sud] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Jae-Jin Kim [Corée du Sud] ; In-Geol Choi [Corée du Sud] | Comprehensive genomic and transcriptomic analysis of polycyclic aromatic hydrocarbon degradation by a mycoremediation fungus, Dentipellis sp. KUC8613. |
000308 (2019) |
Éva Almási [Hongrie] ; Neha Sahu [Hongrie] ; Krisztina Krizsán [Hongrie] ; Balázs Bálint [Hongrie] ; Gábor M. Kovács [Hongrie] ; Brigitta Kiss [Hongrie] ; Judit Cseklye [Hongrie] ; Elodie Drula [France] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; István Nagy [Hongrie] ; Mansi Chovatia [États-Unis] ; Catherine Adam [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Lászl G. Nagy [Hongrie] | Comparative genomics reveals unique wood-decay strategies and fruiting body development in the Schizophyllaceae. |
000393 (2018) |
Chiaki Hori [Japon] ; Jill Gaskell [États-Unis] ; Dan Cullen [États-Unis] ; Grzegorz Sabat [États-Unis] ; Philip E. Stewart [États-Unis] ; Kathleen Lail [États-Unis] ; Yi Peng [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Annegret Kohler [France] ; Laure Fauchery [France] ; Francis Martin [France] ; Carolyn A. Zeiner [États-Unis] ; Jennifer M. Bhatnagar [États-Unis] | Multi-omic Analyses of Extensively Decayed Pinus contorta Reveal Expression of a Diverse Array of Lignocellulose-Degrading Enzymes. |
000410 (2018) |
Shingo Miyauchi [France] ; Anaïs Rancon [France] ; Elodie Drula [France] ; Hayat Hage [France] ; Delphine Chaduli [France] ; Anne Favel [France] ; Sacha Grisel [France] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Isabelle Herpoël-Gimbert [France] ; Francisco J. Ruiz-Due As [Espagne] ; Didier Chevret [France] ; Matthieu Hainaut [France] ; Junyan Lin [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Laurence Lesage-Meessen [France] ; David Navarro [France] ; Robert Riley [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Simeng Zhou [France] ; Sana Raouche [France] ; Marie-Noëlle Rosso [France] | Integrative visual omics of the white-rot fungus Polyporus brumalis exposes the biotechnological potential of its oxidative enzymes for delignifying raw plant biomass. |
000421 (2018) |
Baojun Wu [États-Unis] ; Zhangyi Xu [République populaire de Chine] ; Alicia Knudson [États-Unis] ; Alexis Carlson [États-Unis] ; Naiyao Chen [République populaire de Chine] ; Sam Kovaka [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Christa Pennachio [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Wendy Schakwitz [États-Unis] ; Kiwamu Umezawa [États-Unis, Japon] ; Robin A. Ohm [Pays-Bas] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Lászl G. Nagy [Hongrie] ; John Gibbons [États-Unis] ; David Hibbett [États-Unis] | Genomics and Development of Lentinus tigrinus: A White-Rot Wood-Decaying Mushroom with Dimorphic Fruiting Bodies. |
000448 (2018) |
Miia R. M Kel [Finlande] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Zoraide Granchi [Pays-Bas] ; Thomas Chin-A-Woeng [Pays-Bas] ; Rosa Hegi [Pays-Bas] ; Sake I. Van Pelt [Pays-Bas] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Matthieu Hainaut [France] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] | Draft Genome Sequence of the Basidiomycete White-Rot Fungus Phlebia centrifuga. |
000451 (2018) |
Paul Daly [Pays-Bas] ; Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Christopher S. Lancefield [Pays-Bas] ; Samuel O. Purvine [États-Unis] ; Young-Mo Kim [États-Unis] ; Erika M. Zink [États-Unis] ; Alice Dohnalkova [États-Unis] ; Vasanth R. Singan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; David Dilworth [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Errol Robinson [États-Unis] ; Galya Orr [États-Unis] ; Scott E. Baker [États-Unis] ; Pieter C A. Bruijnincx [Pays-Bas] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] | Dichomitus squalens partially tailors its molecular responses to the composition of solid wood. |
000562 (2017) |
Lászl G. Nagy [Hongrie] ; Robert Riley [États-Unis] ; Philip J. Bergmann [États-Unis] ; Krisztina Krizsán [Hongrie] ; Francis M. Martin [France] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Dan Cullen [États-Unis] ; David S. Hibbett [États-Unis] | Genetic Bases of Fungal White Rot Wood Decay Predicted by Phylogenomic Analysis of Correlated Gene-Phenotype Evolution. |
000725 (2016) |
Otto Miettinen [Finlande] ; Robert Riley [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Dan Cullen [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Finlande] ; Matthieu Hainaut [France] ; Annele Hatakka [Finlande] ; Bernard Henrissat [Arabie saoudite] ; Kristiina Hildén [Finlande] ; Rita Kuo [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Laura Sandor [États-Unis] ; Joseph W. Spatafora [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; David S. Hibbett [États-Unis] | Draft Genome Sequence of the White-Rot Fungus Obba rivulosa 3A-2. |
000742 (2016) |
Manuel Alfaro [Espagne] ; Raúl Castanera [Espagne] ; José L. Lavín [Espagne] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; José A. Oguiza [Espagne] ; Lucía Ramírez [Espagne] ; Antonio G. Pisabarro [Espagne] | Comparative and transcriptional analysis of the predicted secretome in the lignocellulose-degrading basidiomycete fungus Pleurotus ostreatus. |
000745 (2016) |
Lászl G. Nagy [Hongrie] ; Robert Riley [États-Unis] ; Andrew Tritt [États-Unis] ; Catherine Adam [États-Unis] ; Chris Daum [États-Unis] ; Dimitrios Floudas [Suède] ; Hui Sun [États-Unis] ; Jagjit S. Yadav ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Karl-Henrik Larsson [Norvège] ; Kenji Matsuura [Japon] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Rita Kuo [États-Unis] ; Robin A. Ohm [Pays-Bas] ; Sukanta S. Bhattacharya ; Takashi Shirouzu [Japon] ; Yuko Yoshinaga [États-Unis] ; Francis M. Martin [France] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; David S. Hibbett [Hongrie] | Comparative Genomics of Early-Diverging Mushroom-Forming Fungi Provides Insights into the Origins of Lignocellulose Decay Capabilities. |
000837 (2015) |
Byoungnam Min [Corée du Sud] ; Hongjae Park [Corée du Sud] ; Yeongseon Jang [Corée du Sud] ; Jae-Jin Kim [Corée du Sud] ; Kyoung Heon Kim [Corée du Sud] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Joseph W. Spatafora [États-Unis] ; In-Geol Choi [Corée du Sud] | Genome sequence of a white rot fungus Schizopora paradoxa KUC8140 for wood decay and mycoremediation. |
000856 (2015) |
Dimitrios Floudas [Suède] ; Benjamin W. Held [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Laszlo G. Nagy [Hongrie] ; Gage Koehler [États-Unis] ; Anthony S. Ransdell [États-Unis] ; Hina Younus [États-Unis] ; Julianna Chow [États-Unis] ; Jennifer Chiniquy [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Andrew Tritt [États-Unis] ; Hui Sun [États-Unis] ; Sajeet Haridas [États-Unis] ; Kurt Labutti [États-Unis] ; Robin A. Ohm [Pays-Bas] ; Ursula Kües [Allemagne] ; Robert A. Blanchette [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Robert E. Minto [États-Unis] ; David S. Hibbett [États-Unis] | Evolution of novel wood decay mechanisms in Agaricales revealed by the genome sequences of Fistulina hepatica and Cylindrobasidium torrendii. |
000862 (2015) |
Marie Couturier [France] ; David Navarro [France] ; Didier Chevret [France] ; Bernard Henrissat [France] ; François Piumi [France] ; Francisco J. Ruiz-Due As [Espagne] ; Angel T. Martinez [Espagne] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Jean-Guy Berrin [France] ; Emma R. Master [Canada] ; Marie-Noëlle Rosso [France] | Enhanced degradation of softwood versus hardwood by the white-rot fungus Pycnoporus coccineus. |
000990 (2014) |
Robin A. Ohm [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Asaf Salamov [États-Unis] ; Byoungnam Min [Corée du Sud] ; In-Geol Choi [Corée du Sud] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] | Genomics of wood-degrading fungi. |