Ident. | Authors (with country if any) | Title |
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000051 (2020) |
Paul Daly [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Vasanth R. Singan [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] | Mixtures of aromatic compounds induce ligninolytic gene expression in the wood-rotting fungus Dichomitus squalens. |
000070 (2020) |
Hans Kristian Mattila [Finlande] ; Mari M Kinen [Finlande] ; Taina Lundell [Finlande] | Hypoxia is regulating enzymatic wood decomposition and intracellular carbohydrate metabolism in filamentous white rot fungus. |
000077 (2020) |
Abbot O. Oghenekaro [Nigeria, Finlande, Canada] ; Andriy Kovalchuk [Finlande] ; Tommaso Raffaello [Finlande] ; Susana Camarero [Espagne] ; Markus Gressler [Allemagne] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Juna Lee [États-Unis] ; Mengxia Liu [Finlande] ; Angel T. Martínez [Espagne] ; Otto Miettinen [Finlande] ; Sirma Mihaltcheva [États-Unis] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Fei Ren [Finlande, République populaire de Chine] ; Robert Riley [États-Unis] ; Francisco Javier Ruiz-Due As [Espagne] ; Ana Serrano [Espagne] ; Michael R. Thon [Espagne] ; Zilan Wen [Finlande] ; Zhen Zeng [Finlande] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Francis Martin [France] ; Fred O. Asiegbu [Finlande] | Genome sequencing of Rigidoporus microporus provides insights on genes important for wood decay, latex tolerance and interspecific fungal interactions. |
000086 (2020) |
Joona Mikkil [Finlande] ; Mikaela Trogen [Finlande] ; Klaus A Y. Koivu [Finlande] ; Jussi Kontro [Finlande] ; Jaana Kuuskeri [Finlande] ; Riku Maltari [Finlande] ; Zane Dekere [Finlande] ; Marianna Kemell [Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Paula A. Nousiainen [Finlande] ; Michael Hummel [Finlande] ; Jussi Sipil [Finlande] ; Kristiina Hildén [Finlande] | Fungal Treatment Modifies Kraft Lignin for Lignin- and Cellulose-Based Carbon Fiber Precursors. |
000145 (2020) |
Eliana Veloz Villavicencio [Finlande] ; Tuulia Mali [Finlande] ; Hans K. Mattila [Finlande] ; Taina Lundell [Finlande] | Enzyme Activity Profiles Produced on Wood and Straw by Four Fungi of Different Decay Strategies. |
000163 (2020) |
Shingo Miyauchi [France] ; Hayat Hage [France] ; Elodie Drula [France] ; Laurence Lesage-Meessen [France] ; Jean-Guy Berrin [France] ; David Navarro [France] ; Anne Favel [France] ; Delphine Chaduli [France] ; Sacha Grisel [France] ; Mireille Haon [France] ; François Piumi [France] ; Anthony Levasseur ; Anne Lomascolo [France] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Kurt M. Labutti [États-Unis] ; Didier Chevret [France] ; Chris Daum [États-Unis] ; Jérôme Mariette [France] ; Christophe Klopp [France] ; Daniel Cullen [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] ; Allen C. Gathman [États-Unis] ; Matthieu Hainaut [France] ; Bernard Henrissat [France] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Ursula Kües [Allemagne] ; Walt Lilly [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Angel T. Martinez [Espagne] ; Mélanie Morel-Rouhier [France] ; Emmanuelle Morin [France] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Arthur F J. Ram [Pays-Bas] ; Han A B. Wösten [Pays-Bas] ; Francisco J. Ruiz-Due As [Espagne] ; Robert Riley [États-Unis] ; Eric Record [France] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Marie-Noëlle Rosso [France] | Conserved white-rot enzymatic mechanism for wood decay in the Basidiomycota genus Pycnoporus. |
000203 (2019) |
Joanna E. Kowalczyk [Finlande] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Megan Pawlowski [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Vasanth Singan [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] | The White-Rot Basidiomycete Dichomitus squalens Shows Highly Specific Transcriptional Response to Lignocellulose-Related Aromatic Compounds. |
000264 (2019) |
Paul Daly [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Marcos Di Falco [Canada] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Adrian Tsang [Canada] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] | Glucose-Mediated Repression of Plant Biomass Utilization in the White-Rot Fungus Dichomitus squalens. |
000267 (2019) |
Mari M Kinen [Finlande] ; Jaana Kuuskeri [Finlande] ; Pia Laine [Finlande] ; Olli-Pekka Smolander [Finlande, Estonie] ; Andriy Kovalchuk [Finlande] ; Zhen Zeng [Finlande] ; Fred O. Asiegbu [Finlande] ; Lars Paulin [Finlande] ; Petri Auvinen [Finlande] ; Taina Lundell [Finlande] | Genome description of Phlebia radiata 79 with comparative genomics analysis on lignocellulose decomposition machinery of phlebioid fungi. |
000295 (2019) |
Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Paul Daly [Pays-Bas] ; Bill Andreopoulos [États-Unis] ; Jasmyn Pangilinan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Chris Daum [États-Unis] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Finlande, Pays-Bas] | Draft Genome Sequences of Three Monokaryotic Isolates of the White-Rot Basidiomycete Fungus Dichomitus squalens. |
000300 (2019) |
Tuulia Mali [Finlande] ; Mari M Ki [Finlande] ; Heidi Hellén [Finlande] ; Jussi Heinonsalo [Finlande] ; Jaana B Ck [Finlande] ; Taina Lundell [Finlande] | Decomposition of spruce wood and release of volatile organic compounds depend on decay type, fungal interactions and enzyme production patterns. |
000348 (2018) |
Mari A. M Kinen [Finlande] ; Netta Risulainen [Finlande] ; Hans Mattila [Finlande] ; Taina K. Lundell [Finlande] | Transcription of lignocellulose-decomposition associated genes, enzyme activities and production of ethanol upon bioconversion of waste substrate by Phlebia radiata. |
000358 (2018) |
Mila Marinovi [Finlande] ; Maria Victoria Aguilar-Pontes [Pays-Bas] ; Miaomiao Zhou [Pays-Bas] ; Otto Miettinen [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Kristiina Hildén [Finlande] | Temporal transcriptome analysis of the white-rot fungus Obba rivulosa shows expression of a constitutive set of plant cell wall degradation targeted genes during growth on solid spruce wood. |
000372 (2018) |
Mila Marinovi [Finlande] ; Paula Nousiainen [Finlande] ; Adiphol Dilokpimol [Pays-Bas] ; Jussi Kontro [Finlande] ; Robin Moore [Finlande] ; Jussi Sipil [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Finlande, Pays-Bas] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Kristiina Hildén [Finlande] | Selective Cleavage of Lignin β-O-4 Aryl Ether Bond by β-Etherase of the White-Rot Fungus Dichomitus squalens. |
000388 (2018) |
Firoz Shah [Finlande] ; Tuulia Mali [Finlande] ; Taina K. Lundell [Finlande] | Polyporales Brown Rot Species Fomitopsis pinicola: Enzyme Activity Profiles, Oxalic Acid Production, and Fe3+-Reducing Metabolite Secretion. |
000412 (2018) |
Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Tedros Yonatan Issak [Pays-Bas] ; Paul Daly [Pays-Bas] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] ; Miia R. M Kel [Finlande] | Induction of Genes Encoding Plant Cell Wall-Degrading Carbohydrate-Active Enzymes by Lignocellulose-Derived Monosaccharides and Cellobiose in the White-Rot Fungus Dichomitus squalens. |
000445 (2018) |
E. Jurak [Finlande, Pays-Bas] ; H. Suzuki [Canada] ; G. Van Erven [Pays-Bas] ; J A Gandier [Canada] ; P. Wong [Canada] ; K. Chan [Canada] ; C Y Ho [Canada] ; Y. Gong [Canada] ; E. Tillier [Canada] ; M-N Rosso [France] ; M A Kabel [Pays-Bas] ; S. Miyauchi [France] ; E R Master [Finlande, Canada] | Dynamics of the Phanerochaete carnosa transcriptome during growth on aspen and spruce. |
000448 (2018) |
Miia R. M Kel [Finlande] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Zoraide Granchi [Pays-Bas] ; Thomas Chin-A-Woeng [Pays-Bas] ; Rosa Hegi [Pays-Bas] ; Sake I. Van Pelt [Pays-Bas] ; Steven Ahrendt [États-Unis] ; Robert Riley [États-Unis] ; Matthieu Hainaut [France] ; Bernard Henrissat [France, Arabie saoudite] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] | Draft Genome Sequence of the Basidiomycete White-Rot Fungus Phlebia centrifuga. |
000451 (2018) |
Paul Daly [Pays-Bas] ; Sara Casado L Pez [Pays-Bas] ; Mao Peng [Pays-Bas] ; Christopher S. Lancefield [Pays-Bas] ; Samuel O. Purvine [États-Unis] ; Young-Mo Kim [États-Unis] ; Erika M. Zink [États-Unis] ; Alice Dohnalkova [États-Unis] ; Vasanth R. Singan [États-Unis] ; Anna Lipzen [États-Unis] ; David Dilworth [États-Unis] ; Mei Wang [États-Unis] ; Vivian Ng [États-Unis] ; Errol Robinson [États-Unis] ; Galya Orr [États-Unis] ; Scott E. Baker [États-Unis] ; Pieter C A. Bruijnincx [Pays-Bas] ; Kristiina S. Hildén [Finlande] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Miia R. M Kel [Finlande] ; Ronald P. De Vries [Pays-Bas, Finlande] | Dichomitus squalens partially tailors its molecular responses to the composition of solid wood. |
000458 (2018) |
Aku Korhonen [Finlande] ; Jaya Seelan Sathiya Seelan [Malaisie] ; Otto Miettinen [Finlande] | Cryptic species diversity in polypores: the Skeletocutis nivea species complex. |
000504 (2017) |
Johanna Rytioja [Finlande] ; Kristiina Hildén [Finlande] ; Marcos Di Falco [Finlande] ; Miaomiao Zhou [Pays-Bas] ; Maria Victoria Aguilar-Pontes [Pays-Bas] ; Outi-Maaria Sietiö [Finlande] ; Adrian Tsang [Canada] ; Ronald P. De Vries [Finlande, Pays-Bas] ; Miia R. M Kel [Finlande] | The molecular response of the white-rot fungus Dichomitus squalens to wood and non-woody biomass as examined by transcriptome and exoproteome analyses. |