Phylogeny reconstruction and hybrid analysis of populus (Salicaceae) based on nucleotide sequences of multiple single-copy nuclear genes and plastid fragments.
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Auteurs : Zhaoshan Wang [République populaire de Chine] ; Shuhui Du [République populaire de Chine] ; Selvadurai Dayanandan [Canada] ; Dongsheng Wang [République populaire de Chine] ; Yanfei Zeng [République populaire de Chine] ; Jianguo Zhang [République populaire de Chine]Source :
- PloS one [ 1932-6203 ] ; 2014.
Descripteurs français
- KwdFr :
- MESH :
- génétique : Plastes, Populus.
- classification : Chimère, Données de séquences moléculaires, Dosage génique, Gènes de plante, Phylogenèse, Populus.
English descriptors
- KwdEn :
- MESH :
- classification : Populus.
- genetics : Plastids, Populus.
- Chimera, Gene Dosage, Genes, Plant, Molecular Sequence Data, Phylogeny.
Abstract
Populus (Salicaceae) is one of the most economically and ecologically important genera of forest trees. The complex reticulate evolution and lack of highly variable orthologous single-copy DNA markers have posed difficulties in resolving the phylogeny of this genus. Based on a large data set of nuclear and plastid DNA sequences, we reconstructed robust phylogeny of Populus using parsimony, maximum likelihood and Bayesian inference methods. The resulting phylogenetic trees showed better resolution at both inter- and intra-sectional level than previous studies. The results revealed that (1) the plastid-based phylogenetic tree resulted in two main clades, suggesting an early divergence of the maternal progenitors of Populus; (2) three advanced sections (Populus, Aigeiros and Tacamahaca) are of hybrid origin; (3) species of the section Tacamahaca could be divided into two major groups based on plastid and nuclear DNA data, suggesting a polyphyletic nature of the section; and (4) many species proved to be of hybrid origin based on the incongruence between plastid and nuclear DNA trees. Reticulate evolution may have played a significant role in the evolution history of Populus by facilitating rapid adaptive radiations into different environments.
DOI: 10.1371/journal.pone.0103645
PubMed: 25116432
PubMed Central: PMC4130529
Affiliations:
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