| Ident. | Authors (with country if any) | Title |
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| 000306 |
Manzar Abbas [République populaire de Chine] ; Ilona Peszlen [États-Unis] ; Rui Shi [États-Unis] ; Hoon Kim [États-Unis] ; Rui Katahira [États-Unis] ; Kabindra Kafle [États-Unis] ; Zhouyang Xiang [République populaire de Chine] ; Xiong Huang [République populaire de Chine] ; Douyong Min [République populaire de Chine] ; Makarem Mohamadamin [États-Unis] ; Chenmin Yang [États-Unis] ; Xinren Dai [République populaire de Chine] ; Xiaojing Yan [République populaire de Chine] ; Sunkyu Park [États-Unis] ; Yun Li [République populaire de Chine] ; Seong H. Kim [États-Unis] ; Mark Davis [États-Unis] ; John Ralph [États-Unis] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis, République populaire de Chine] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] | Involvement of CesA4, CesA7-A/B and CesA8-A/B in secondary wall formation in Populus trichocarpa wood. |
| 000914 |
Hao Chen [République populaire de Chine, États-Unis] ; Jack P. Wang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Huizi Liu [République populaire de Chine] ; Huiyu Li [République populaire de Chine] ; Ying-Chung Jimmy Lin [République populaire de Chine, Taïwan] ; Rui Shi [États-Unis] ; Chenmin Yang [États-Unis] ; Jinghui Gao [République populaire de Chine] ; Chenguang Zhou [République populaire de Chine] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Wei Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] | Hierarchical Transcription Factor and Chromatin Binding Network for Wood Formation in Black Cottonwood (Populus trichocarpa). |
| 000A98 |
Xiaojing Yan [République populaire de Chine] ; Jie Liu [États-Unis] ; Hoon Kim [États-Unis] ; Baoguang Liu [République populaire de Chine] ; Xiong Huang [République populaire de Chine] ; Zhichang Yang [États-Unis] ; Ying-Chung Jimmy Lin [République populaire de Chine, Taïwan] ; Hao Chen [États-Unis] ; Chenmin Yang [États-Unis] ; Jack P. Wang [États-Unis, République populaire de Chine] ; David C. Muddiman [États-Unis] ; John Ralph [États-Unis] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Vincent L. Chiang [États-Unis, République populaire de Chine] | CAD1 and CCR2 protein complex formation in monolignol biosynthesis in Populus trichocarpa. |
| 000E25 |
Jack P. Wang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Megan L. Matthews [États-Unis] ; Cranos M. Williams [États-Unis] ; Rui Shi [États-Unis] ; Chenmin Yang [États-Unis] ; Sermsawat Tunlaya-Anukit [États-Unis] ; Hsi-Chuan Chen [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Jie Liu [États-Unis] ; Chien-Yuan Lin [États-Unis] ; Punith Naik [États-Unis] ; Ying-Hsuan Sun [Taïwan] ; Philip L. Loziuk [États-Unis] ; Ting-Feng Yeh [Taïwan] ; Hoon Kim [États-Unis] ; Erica Gjersing [États-Unis] ; Todd Shollenberger [États-Unis] ; Christopher M. Shuford [États-Unis] ; Jina Song [États-Unis] ; Zachary Miller [États-Unis] ; Yung-Yun Huang [États-Unis] ; Charles W. Edmunds [États-Unis] ; Baoguang Liu [République populaire de Chine] ; Yi Sun [République populaire de Chine] ; Ying-Chung Jimmy Lin [République populaire de Chine, États-Unis, Taïwan] ; Wei Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Hao Chen [États-Unis] ; Ilona Peszlen [États-Unis] ; Joel J. Ducoste [États-Unis] ; John Ralph [États-Unis] ; Hou-Min Chang [États-Unis] ; David C. Muddiman [États-Unis] ; Mark F. Davis [États-Unis] ; Chris Smith [États-Unis] ; Fikret Isik [États-Unis] ; Ronald Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [République populaire de Chine, États-Unis] | Improving wood properties for wood utilization through multi-omics integration in lignin biosynthesis. |
| 001148 |
Rui Shi [États-Unis] ; Jack P. Wang [États-Unis, République populaire de Chine] ; Ying-Chung Lin [États-Unis, République populaire de Chine, Taïwan] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Ying-Hsuan Sun [Taïwan] ; Hao Chen [États-Unis] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis, République populaire de Chine] | Tissue and cell-type co-expression networks of transcription factors and wood component genes in Populus trichocarpa. |
| 001218 |
Ying-Chung Jimmy Lin [République populaire de Chine, Taïwan, États-Unis] ; Hao Chen [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Wei Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Jack P. Wang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Rui Shi [États-Unis] ; Sermsawat Tunlaya-Anukit [États-Unis] ; Peng Shuai [États-Unis, République populaire de Chine] ; Zhifeng Wang [République populaire de Chine] ; Hongyan Ma [République populaire de Chine] ; Huiyu Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Ying-Hsuan Sun [Taïwan] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] | Reciprocal cross-regulation of VND and SND multigene TF families for wood formation in Populus trichocarpa. |
| 001497 |
Sara E. Blumer-Schuette [États-Unis] ; Jeffrey V. Zurawski [États-Unis] ; Jonathan M. Conway [États-Unis] ; Piyum Khatibi [États-Unis] ; Derrick L. Lewis [États-Unis] ; Quanzi Li [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] ; Robert M. Kelly [États-Unis] | Caldicellulosiruptor saccharolyticus transcriptomes reveal consequences of chemical pretreatment and genetic modification of lignocellulose. |
| 001B85 |
Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Ting-Feng Yeh ; Chenmin Yang ; Jingyuan Song ; Zenn-Zong Chen ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Populus trichocarpa. |
| 001D96 |
Philip L. Loziuk [États-Unis] ; Jennifer Parker [États-Unis] ; Wei Li [États-Unis] ; Chien-Yuan Lin [États-Unis] ; Jack P. Wang [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] ; David C. Muddiman [États-Unis] | Elucidation of Xylem-Specific Transcription Factors and Absolute Quantification of Enzymes Regulating Cellulose Biosynthesis in Populus trichocarpa. |
| 001F28 |
Chien-Yuan Lin [États-Unis] ; Jack P. Wang [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Hsi-Chuan Chen [États-Unis] ; Jie Liu [États-Unis] ; Philip Loziuk [États-Unis] ; Jina Song [États-Unis] ; Cranos Williams [États-Unis] ; David C. Muddiman [États-Unis] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] | 4-Coumaroyl and caffeoyl shikimic acids inhibit 4-coumaric acid:coenzyme A ligases and modulate metabolic flux for 3-hydroxylation in monolignol biosynthesis of Populus trichocarpa. |
| 002029 |
Hsi-Chuan Chen [République populaire de Chine] ; Jina Song ; Jack P. Wang ; Ying-Chung Lin ; Joel Ducoste ; Christopher M. Shuford ; Jie Liu ; Quanzi Li ; Rui Shi ; Angelito Nepomuceno ; Fikret Isik ; David C. Muddiman ; Cranos Williams ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Systems biology of lignin biosynthesis in Populus trichocarpa: heteromeric 4-coumaric acid:coenzyme A ligase protein complex formation, regulation, and numerical modeling. |
| 002311 |
Jack P. Wang [République populaire de Chine] ; Punith P. Naik ; Hsi-Chuan Chen ; Rui Shi ; Chien-Yuan Lin ; Jie Liu ; Christopher M. Shuford ; Quanzi Li ; Ying-Hsuan Sun ; Sermsawat Tunlaya-Anukit ; Cranos M. Williams ; David C. Muddiman ; Joel J. Ducoste ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Complete proteomic-based enzyme reaction and inhibition kinetics reveal how monolignol biosynthetic enzyme families affect metabolic flux and lignin in Populus trichocarpa. |
| 002389 |
Ying-Chung Lin [États-Unis] ; Wei Li [États-Unis] ; Hao Chen [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Ying-Hsuan Sun [Taïwan] ; Rui Shi [États-Unis] ; Chien-Yuan Lin [États-Unis] ; Jack P. Wang [États-Unis] ; Hsi-Chuan Chen [États-Unis] ; Ling Chuang [États-Unis] ; Guan-Zheng Qu [République populaire de Chine] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] | A simple improved-throughput xylem protoplast system for studying wood formation. |
| 002390 |
Wei Li [États-Unis] ; Ying-Chung Lin [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Rui Shi [États-Unis] ; Chien-Yuan Lin [États-Unis] ; Hao Chen [États-Unis] ; Ling Chuang [États-Unis] ; Guan-Zheng Qu [République populaire de Chine] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] | A robust chromatin immunoprecipitation protocol for studying transcription factor-DNA interactions and histone modifications in wood-forming tissue. |
| 002404 |
Chien-Yuan Lin [États-Unis] ; Jack P. Wang [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Hsi-Chuan Chen [États-Unis] ; Jie Liu [États-Unis] ; Philip Loziuk [États-Unis] ; Jina Song [États-Unis] ; Cranos Williams [États-Unis] ; David C. Muddiman [États-Unis] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] | 4-Coumaroyl and Caffeoyl Shikimic Acids Inhibit 4-Coumaric Acid: Coenzyme A Ligases and Modulate Metabolic Flux for 3-Hydroxylation in Monolignol Biosynthesis of Populus trichocarpa. |
| 002431 |
Philip L. Loziuk [États-Unis] ; Jack Wang ; Quanzi Li ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang ; David C. Muddiman | Understanding the role of proteolytic digestion on discovery and targeted proteomic measurements using liquid chromatography tandem mass spectrometry and design of experiments. |
| 002498 |
Ying-Chung Lin [États-Unis] ; Wei Li ; Ying-Hsuan Sun ; Sapna Kumari ; Hairong Wei ; Quanzi Li ; Sermsawat Tunlaya-Anukit ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | SND1 transcription factor-directed quantitative functional hierarchical genetic regulatory network in wood formation in Populus trichocarpa. |
| 002506 |
Rui Shi [États-Unis] ; Christopher M. Shuford ; Jack P. Wang ; Ying-Hsuan Sun ; Zhichang Yang ; Hsi-Chuan Chen ; Sermsawat Tunlaya-Anukit ; Quanzi Li ; Jie Liu ; David C. Muddiman ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Regulation of phenylalanine ammonia-lyase (PAL) gene family in wood forming tissue of Populus trichocarpa. |
| 002521 |
Shanfa Lu [République populaire de Chine] ; Quanzi Li ; Hairong Wei ; Mao-Ju Chang ; Sermsawat Tunlaya-Anukit ; Hoon Kim ; Jie Liu ; Jingyuan Song ; Ying-Hsuan Sun ; Lichai Yuan ; Ting-Feng Yeh ; Ilona Peszlen ; John Ralph ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Ptr-miR397a is a negative regulator of laccase genes affecting lignin content in Populus trichocarpa. |
| 002579 |
Hsi-Chuan Chen [États-Unis] ; Jina Song ; Cranos M. Williams ; Christopher M. Shuford ; Jie Liu ; Jack P. Wang ; Quanzi Li ; Rui Shi ; Emine Gokce ; Joel Ducoste ; David C. Muddiman ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Monolignol pathway 4-coumaric acid:coenzyme A ligases in Populus trichocarpa: novel specificity, metabolic regulation, and simulation of coenzyme A ligation fluxes. |
| 002911 |
Quanzi Li [États-Unis] ; Ying-Chung Lin ; Ying-Hsuan Sun ; Jian Song ; Hao Chen ; Xing-Hai Zhang ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Splice variant of the SND1 transcription factor is a dominant negative of SND1 members and their regulation in Populus trichocarpa. |
| 002A75 |
Jack P. Wang [États-Unis] ; Christopher M. Shuford ; Quanzi Li ; Jina Song ; Ying-Chung Lin ; Ying-Hsuan Sun ; Hsi-Chuan Chen ; Cranos M. Williams ; David C. Muddiman ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Functional redundancy of the two 5-hydroxylases in monolignol biosynthesis of Populus trichocarpa: LC-MS/MS based protein quantification and metabolic flux analysis. |
| 002B50 |
Christopher M. Shuford [États-Unis] ; Quanzi Li ; Ying-Hsuan Sun ; Hsi-Chuan Chen ; Jack Wang ; Rui Shi ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang ; David C. Muddiman | Comprehensive quantification of monolignol-pathway enzymes in Populus trichocarpa by protein cleavage isotope dilution mass spectrometry. |
| 002C20 |
Jie Liu [États-Unis] ; Rui Shi ; Quanzi Li ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | A standard reaction condition and a single HPLC separation system are sufficient for estimation of monolignol biosynthetic pathway enzyme activities. |
| 002D96 |
Hsi-Chuan Chen [États-Unis] ; Quanzi Li ; Christopher M. Shuford ; Jie Liu ; David C. Muddiman ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Membrane protein complexes catalyze both 4- and 3-hydroxylation of cinnamic acid derivatives in monolignol biosynthesis. |
| 002F16 |
Quanzi Li [États-Unis] ; Douyong Min ; Jack Peng-Yu Wang ; Ilona Peszlen ; Laszlo Horvath ; Balazs Horvath ; Yufuko Nishimura ; Hasan Jameel ; Hou-Min Chang ; Vincent L. Chiang | Down-regulation of glycosyltransferase 8D genes in Populus trichocarpa caused reduced mechanical strength and xylan content in wood. |
| 002F59 |
Chuanzhen Zhou [États-Unis] ; Quanzi Li ; Vincent L. Chiang ; Lucian A. Lucia ; Dieter P. Griffis | Chemical and spatial differentiation of syringyl and guaiacyl lignins in poplar wood via time-of-flight secondary ion mass spectrometry. |
| 003069 |
Rui Shi [États-Unis] ; Ying-Hsuan Sun ; Quanzi Li ; Steffen Heber ; Ronald Sederoff ; Vincent L. Chiang | Towards a systems approach for lignin biosynthesis in Populus trichocarpa: transcript abundance and specificity of the monolignol biosynthetic genes. |
