Ident. | Authors (with country if any) | Title |
---|
000221 (2020) |
Allison M. Veach [États-Unis] ; Huaihai Chen [États-Unis] ; Zamin K. Yang [États-Unis] ; Audrey D. Labbe [États-Unis] ; Nancy L. Engle [États-Unis] ; Timothy J. Tschaplinski [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Melissa A. Cregger [Pays-Bas, États-Unis] | Plant Hosts Modify Belowground Microbial Community Response to Extreme Drought. |
000283 (2020) |
Dana L. Carper [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Leah H. Burdick [États-Unis] ; Udaya C. Kalluri [Pays-Bas] ; Dale A. Pelletier [Pays-Bas] | Draft Genome Sequence of Tumebacillus sp. Strain BK434, Isolated from the Roots of Eastern Cottonwood. |
000382 (2020) |
Dale A. Pelletier [Pays-Bas] ; Leah H. Burdick [États-Unis] ; Mircea Podar [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Udaya C. Kalluri [États-Unis] | Draft Genome Sequence of Larkinella sp. Strain BK230, Isolated from Populus deltoides Roots. |
000899 (2019) |
Allison M. Veach [États-Unis] ; Reese Morris [États-Unis] ; Daniel Z. Yip [États-Unis] ; Zamin K. Yang [États-Unis] ; Nancy L. Engle [États-Unis] ; Melissa A. Cregger [États-Unis] ; Timothy J. Tschaplinski [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] | Rhizosphere microbiomes diverge among Populus trichocarpa plant-host genotypes and chemotypes, but it depends on soil origin. |
000A55 (2019) |
Hui-Ling Liao [États-Unis] ; Gregory Bonito [États-Unis] ; J Alejandro Rojas [États-Unis] ; Khalid Hameed [États-Unis] ; Steven Wu [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Jessy Labbé [États-Unis] ; Gerald A. Tuskan [États-Unis] ; Francis Martin [France] ; Igor V. Grigoriev [États-Unis] ; Rytas Vilgalys [États-Unis] | Fungal Endophytes of Populus trichocarpa Alter Host Phenotype, Gene Expression, and Rhizobiome Composition. |
000A76 (2019) |
Ian M. Ware [États-Unis] ; Michael E. Van Nuland [États-Unis] ; Jennifer A. Schweitzer [États-Unis] ; Zamin Yang [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Lindsay C. Sidak-Loftis [États-Unis] ; Nathan E. Stone [États-Unis] ; Joseph D. Busch [États-Unis] ; David M. Wagner [États-Unis] ; Joseph K. Bailey [États-Unis] | Climate-driven reduction of genetic variation in plant phenology alters soil communities and nutrient pools. |
000D59 (2019) |
Daniel Z. Yip [États-Unis] ; Allison M. Veach [États-Unis] ; Zamin K. Yang [États-Unis] ; Melissa A. Cregger [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] | Methanogenic Archaea dominate mature heartwood habitats of Eastern Cottonwood (Populus deltoides). |
000F12 (2018) |
Tatiana V. Karpinets [États-Unis] ; Vancheswaran Gopalakrishnan [États-Unis] ; Jennifer Wargo [États-Unis] ; Andrew P. Futreal [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Jianhua Zhang [États-Unis] | Linking Associations of Rare Low-Abundance Species to Their Environments by Association Networks. |
000F79 (2018) |
Collin M. Timm [États-Unis] ; Kelsey R. Carter [États-Unis] ; Alyssa A. Carrell [États-Unis] ; Se-Ran Jun [États-Unis] ; Sara S. Jawdy [États-Unis] ; Jessica M. Vélez [États-Unis] ; Lee E. Gunter [États-Unis] ; Zamin Yang [États-Unis] ; Intawat Nookaew [États-Unis] ; Nancy L. Engle [États-Unis] ; Tse-Yuan S. Lu [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Timothy J. Tschaplinski [États-Unis] ; Mitchel J. Doktycz [États-Unis] ; Gerald A. Tuskan [États-Unis] ; Dale A. Pelletier [États-Unis] ; David J. Weston [États-Unis] | Abiotic Stresses Shift Belowground Populus-Associated Bacteria Toward a Core Stress Microbiome. |
001710 (2016) |
Sagar M. Utturkar [États-Unis] ; W Nathan Cude [États-Unis] ; Michael S. Robeson [États-Unis] ; Zamin K. Yang [États-Unis] ; Dawn M. Klingeman [États-Unis] ; Miriam L. Land [États-Unis] ; Steve L. Allman [États-Unis] ; Tse-Yuan S. Lu [États-Unis] ; Steven D. Brown [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Mircea Podar [États-Unis] ; Mitchel J. Doktycz [États-Unis] ; Dale A. Pelletier [Pays-Bas] | Enrichment of Root Endophytic Bacteria from Populus deltoides and Single-Cell-Genomics Analysis. |
001805 (2016) |
Amber N. Bible [États-Unis] ; Sarah J. Fletcher [États-Unis] ; Dale A. Pelletier [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Sara S. Jawdy [États-Unis] ; David J. Weston [États-Unis] ; Nancy L. Engle [États-Unis] ; Timothy Tschaplinski [États-Unis] ; Rachel Masyuko [États-Unis] ; Sneha Polisetti [États-Unis] ; Paul W. Bohn [États-Unis] ; Teresa A. Coutinho [Afrique du Sud] ; Mitchel J. Doktycz [États-Unis] ; Jennifer L. Morrell-Falvey [États-Unis] | A Carotenoid-Deficient Mutant in Pantoea sp. YR343, a Bacteria Isolated from the Rhizosphere of Populus deltoides, Is Defective in Root Colonization. |
001A33 (2015) |
Dawn M. Klingeman [États-Unis] ; Sagar Utturkar [États-Unis] ; Tse-Yuan S. Lu [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Dale A. Pelletier [États-Unis] ; Steven D. Brown [Pays-Bas] | Draft Genome Sequences of Four Streptomyces Isolates from the Populus trichocarpa Root Endosphere and Rhizosphere. |
001A45 (2015) |
Collin M. Timm [États-Unis] ; Alisha G. Campbell [États-Unis] ; Sagar M. Utturkar [États-Unis] ; Se-Ran Jun [États-Unis] ; Rebecca E. Parales [États-Unis] ; Watumesa A. Tan [États-Unis] ; Michael S. Robeson [États-Unis] ; Tse-Yuan S. Lu [États-Unis] ; Sara Jawdy [États-Unis] ; Steven D. Brown [États-Unis] ; David W. Ussery [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Gerald A. Tuskan [États-Unis] ; Mitchel J. Doktycz [États-Unis] ; David J. Weston [États-Unis] ; Dale A. Pelletier [États-Unis] | Metabolic functions of Pseudomonas fluorescens strains from Populus deltoides depend on rhizosphere or endosphere isolation compartment. |
001A50 (2016) |
Se-Ran Jun [États-Unis] ; Trudy M. Wassenaar [Allemagne] ; Intawat Nookaew [États-Unis] ; Loren Hauser [États-Unis] ; Visanu Wanchai [États-Unis] ; Miriam Land [États-Unis] ; Collin M. Timm [États-Unis] ; Tse-Yuan S. Lu [États-Unis] ; Christopher W. Schadt [États-Unis] ; Mitchel J. Doktycz [États-Unis] ; Dale A. Pelletier [États-Unis] ; David W. Ussery [Pays-Bas] | Diversity of Pseudomonas Genomes, Including Populus-Associated Isolates, as Revealed by Comparative Genome Analysis. |
001F13 (2015) |
Stéphane Hacquard [Allemagne] ; Christopher W. Schadt | Towards a holistic understanding of the beneficial interactions across the Populus microbiome. |
002156 (2014) |
Gregory Bonito [États-Unis] ; Hannah Reynolds ; Michael S. Robeson ; Jessica Nelson ; Brendan P. Hodkinson ; Gerald Tuskan ; Christopher W. Schadt ; Rytas Vilgalys | Plant host and soil origin influence fungal and bacterial assemblages in the roots of woody plants. |
002433 (2013) |
Migun Shakya [États-Unis] ; Neil Gottel ; Hector Castro ; Zamin K. Yang ; Lee Gunter ; Jessy Labbé ; Wellington Muchero ; Gregory Bonito ; Rytas Vilgalys ; Gerald Tuskan ; Mircea Podar ; Christopher W. Schadt | A multifactor analysis of fungal and bacterial community structure in the root microbiome of mature Populus deltoides trees. |
002860 (2012) |
Steven D. Brown [États-Unis] ; Sagar M. Utturkar ; Dawn M. Klingeman ; Courtney M. Johnson ; Stanton L. Martin ; Miriam L. Land ; Tse-Yuan S. Lu ; Christopher W. Schadt ; Mitchel J. Doktycz ; Dale A. Pelletier | Twenty-one genome sequences from Pseudomonas species and 19 genome sequences from diverse bacteria isolated from the rhizosphere and endosphere of Populus deltoides. |
002A80 (2012) |
Steven D. Brown [États-Unis] ; Dawn M. Klingeman ; Tse-Yuan S. Lu ; Courtney M. Johnson ; Sagar M. Utturkar ; Miriam L. Land ; Christopher W. Schadt ; Mitchel J. Doktycz ; Dale A. Pelletier | Draft genome sequence of Rhizobium sp. strain PDO1-076, a bacterium isolated from Populus deltoides. |
002D07 (2011) |
Carolyn F. Weber [États-Unis] ; Donald R. Zak ; Bruce A. Hungate ; Robert B. Jackson ; Rytas Vilgalys ; R David Evans ; Christopher W. Schadt ; J Patrick Megonigal ; Cheryl R. Kuske | Responses of soil cellulolytic fungal communities to elevated atmospheric CO₂ are complex and variable across five ecosystems. |
002D39 (2011) |
Neil R. Gottel [États-Unis] ; Hector F. Castro ; Marilyn Kerley ; Zamin Yang ; Dale A. Pelletier ; Mircea Podar ; Tatiana Karpinets ; Ed Uberbacher ; Gerald A. Tuskan ; Rytas Vilgalys ; Mitchel J. Doktycz ; Christopher W. Schadt | Distinct microbial communities within the endosphere and rhizosphere of Populus deltoides roots across contrasting soil types. |